Tipy pro detekci COVID-19

Pro podporu detekce nového výzkumu a vývoje nových koronavirů (COVID-19) a vakcín, americká centra pro kontrolu a prevenci nemocí (CDC) a čínská vláda dokončily sekvenování nového genomu coronavirus a výsledky předaly americké NCBI GenBank ® databáze]. Nedávno IDT obdržela dotazy od výzkumníků z celého světa o nové soupravě pro detekci koronavirů. Následuje stručný popis.

Americká centra pro kontrolu a prevenci nemocí

Testovací souprava pro americká centra pro kontrolu a prevenci nemocí * Zaměřuje se na různá místa v genu pro nukleokapsidový protein COVID-19 (N-gen). Tři sady primerů / sond v této soupravě musí být spuštěny současně s vnitřní kontrolou zaměřenou na lidský gen RNázy P. Pro každý vzorek pacienta je vyžadováno celkem 4 testů qPCR.

1. Detekční souprava používá jednostupňovou reakci qPCR (tj. Reverzní transkripce a následné reakce qPCR jsou dokončeny ve stejném kroku);

2. Všechny testy 3 N-genů lze považovat za pozitivní výsledek pouze tehdy, když Cq 0010010 lt; 35;

3. Klíčem je reakce vnitřní kontroly RNázy P. Cq 0010010 gt; 3 5 znamená, že extrakce vzorku není dobrá a experiment musí být opakován;

Příslušné dokumenty a experimentální protokoly najdete v nejnovějších amerických střediscích pro kontrolu a prevenci nemocí COVID-19 RT-PCR Test Method Laboratory Guide.

Porovnání s jinými testovacími soupravami

Světová zdravotnická organizace (WHO)

Experimentální program Světové zdravotnické organizace se liší od experimentálního programu amerických center pro kontrolu a prevenci nemocí. Světová zdravotnická organizace doporučuje tři reakce qPCR k potvrzení, zda je infikován COVID-19. Přestože se jedná o kompletní sadu experimentálních protokolů, neexistuje žádná metoda testování CDC v USA, která je rychlejší, protože vyžaduje tři po sobě následující testy a před dalším testem musí být pozorován pozitivní výsledek. Experimentální protokol je testován v následujícím pořadí:

1. E-gen Coronavirus

2. Gen RdRP: zacílení na SARS koronavirus a další netopýrský koronavirus

3. Gen RdRP: cílení na COVID-19

Čínské centrum pro kontrolu a prevenci nemocí

Detekční souprava Čínského centra pro kontrolu a prevenci nemocí doporučuje použití 2 sad primerů / sond. Skupina 1 cílí ORF 1 ab a skupina 2 se používá k potvrzení N-genu COVID-19.

Kontrolní skupina

Předběžná elektronická simulační analýza ukazuje, že kombinace šablony IDT N-genu pro pozitivní kontrolu ** a testovací soupravy USA CDC je podobná použití sad primerů / sond čínského CDC, thajského ministerstva zdravotnictví a HKU. Získané výsledky experimentem jsou konzistentní. Je to samozřejmě založeno na výzkumu elektronické simulace a doporučuje se, aby uživatelé ověřili vybranou soupravu ve své vlastní laboratoři.

Další informace naleznete na adrese www.idtdna.com/pages/landing/coronavirus-research-reagents